Την ενοχή του ιδρυτή της οργάνωσης «Κιβωτός του Κόσμου», Αντώνιου Παπανικολάου και τεσσάρων ακόμη συνεργάτων του ζήτησε η εισαγγελέας στη δίκη που διεξήχθη σε δεύτερο βαθμό, με αντικείμενο τις καταγγελίες για σωματικές κακοποιήσεις και τιμωρητικές συμπεριφορές εντός δομών της οργάνωσης.
Για κάποιες από τις κατηγορίες η εισαγγελέας ζήτησε την αθώωση των κατηγορούμενων κυρίως για κακοποιητικά περιστατικά στη δομή της Χίου, ενώ για δύο κατηγορούμενους που συνδέονται με τη συγκεκριμένη δομή, πρότεινε την πλήρη απαλλαγή τους.
«Ηταν το πρόσωπο της Κιβωτού, το πρόσωπο αναφοράς, όλα περνούσαν από το χέρι του, τίποτα δεν γινόταν αν δεν το ήξερε. Πρόκειται για το εν τοις πράγμασι κεντρικό πρόσωπο και τον ηγέτη της Κιβωτού του Κόσμου», σημείωσε η εισαγγελέας συμπληρώνοντας σχετικά με τους υπόλοιπους κατηγορούμενους, ότι υπήρξαν εργαζομενοι σε δομές της οργάνωσης και δύο εξ αυτών υπήρξαν πρώην ωφελούμενοι της Κιβωτού που στη συνέχεια παρέμειναν ως εργαζόμενοι και είχαν υπό την προστασία τους, τους παθόντες.
Η εισαγγελική λειτουργός πρότεινε στο Τριμελές Εφετείο Πλημμελημάτων την καταδίκη των κατηγορουμένων για το περιστατικό παρατεταμένης απομόνωσης ανηλίκου στη δομή του Ανω Βόλου, ο οποίος προηγουμένως είχε κατατηγορηθεί για κλοπή. «Πρόκειται για περιστατικό που προκάλεσε ψυχικό πόνο στον ανήλικο. Είναι ένα ακραίο μέτρο αυτό που ελήφθη. Συμμετείχε η διευθύντρια της οργάνωσης, ο παιδαγωγός αλλά λόγο είχε και ο πατέρας Αντώνιος, ο οποίος ασκούσε επιρροή και είχε γνώση όλων των ληφθέντων μέτρων σωφρονισμού σύμφωνα με την εισαγγελέα.
«Είχε λόγο σε σημαντικά ζητήματα που σχετίζονται με τους ανήλικους», ανέφερε εξηγώντας πως δεν είναι πειστικός ο ισχυρισμός ότι δεν είχε λάβει γνώση ο πατέρας Αντώνιος γιατί είχε επισκεφθεί εκείνες τις ημέρες τη δομή του Βόλου.
